所謂禪病，是指由禪修方法不當直接引發的身心疾病或顯著障礙。禪病主要表現在身心兩個方面。身體方面的常見禪病，如習慣性的不當坐姿、持續的疼痛、勞損、變形、生理異常與障礙。心理方面的常見禪病，如憂愁、悲傷、狂喜、我慢、幻想、臆想、著欲、著空、知覺扭曲、情緒錯亂、出現幻覺、精神發狂、鬼魅所侵等。
習慣性的不當坐姿，如低頭、仰頭、歪頭、頭左轉、頭右轉、左肩高、右肩高、靠柱、靠牆、東倒西歪、前俯後仰、盤起的兩腿不能均勻受力等。有時不當坐姿可能是因為坐墊不合適、支撐面不平整造成的，但除此以外，多是行者自己不良的坐姿習慣使然。習慣性的不當坐姿，會給身體帶來持續的疼痛、勞損、變形或者生理異常與障礙。至於如何調治，下文中將分別講到。
身體持續的疼痛，是指禪修時疼痛持續並顯著，明顯障礙正常禪修，或者暫停禪修、放鬆休息時仍有明顯的疼痛感。如果在坐禪時，腿、腰等部位出現疼痛但不顯著，或者即使顯著但在放鬆休息時疼痛明顯減輕甚至消失，這是正常現象，不在禪病之列。但如果坐禪時，腿、腰等部位疼痛持續、顯著並明顯障礙正常禪修，即使暫停禪修、放鬆休息時仍有明顯的疼痛感，此即禪病，這通常是由坐姿不當或精進過度所致。後者之所以稱為禪病，是因為會持續、明顯地障礙禪修，還有可能形成以後的禪修恐懼症。另外除腿、腰以外，其它身體部位如頭、眼、肩、背、胸、肋、腹等出現持續疼痛的現象，一般皆為禪病，這些通常是由坐姿、方法、用心不當所致。
坐姿不當所引發的身體疼痛經調整到正確坐姿後即能減輕甚至消失。正確坐姿有三個要點：穩、正、松。如果下盤不穩，上身通常會前俯後仰、東倒西歪。穩即盤腿後兩腿能較均勻受力、共同支撐上身，這樣才能與臀部一起穩固整個身體。如果兩腿受力不均、不能大致對稱地接觸身下的支撐面，坐的時間久了，可能導致上身左傾右斜；又如習慣性的某一條腿在下、另一條腿在上地單盤，往往會造成在下單腿的麻木，時間長了，可能導致兩腿在形體上不對稱。正即身體的端正，主要指頭項、腰椎的正直。只有下盤穩了，上身才能保持端正，避免前俯後仰、東倒西歪，保證氣血順暢、消化良好。松即全身要放鬆。禪修除了上身要保持端正外，還要求全身放鬆，只有這樣才能儘量坐得長久，並且容易引發輕安與喜樂。
如果精進過度或坐禪時心力過猛、意念過強，會導致頭痛、眼痛、眼紅、口幹。這時當放鬆心意，保持覺照、專注但不著力，頭眼痛即減輕、消失。或者暫停禪修來經行、跑香，或者完全放鬆後休息，頭眼痛即減輕、消失。如果坐禪時心意執守除了中下腹以外的身體上身某個部位，時間久了，那個相應部位通常出現疼痛。這時轉移心意至中下腹、腳掌或遍察全身，疼痛即減輕、消失。如果因為調息不當或試圖控制呼吸，也會導致肩背、胸腹、兩肋、腰部疼痛，若調整到自然呼吸，疼痛則減輕、消失。
如果坐姿不當或精進過度所引發的身體障礙沒有及時加以調治，時間久了就會導致身體局部勞損與變形。最容易勞損的是腳踝、膝蓋、坐骨與腰部的筋骨，進而導致局部長期疼痛、麻木、肌肉萎縮、長短腿、坐骨神經痛、腰椎勞損等病變。上身不端正會導致歪脖子、溜肩、駝背。腰部經常硬挺而不能放鬆會導致上身強迫性僵直。如果方法或用心不當所造成的身體障礙沒有及時、有效地加以調治，時間久了會導致身體局部疼痛、痙攣、臟腑內積水以及暫時失明、失聰、呼吸受限、消化不良等臟腑生理功能障礙。
在密集禪修或長期禪修中，由於身心疲勞、緊張，或飲食不調，或睡眠不足，或環境不適，或情緒波動大，會導致一些生理異常或功能障礙，如消化障礙、睡眠障礙，男性發生頻繁的滑精、遺精，女性出現低熱、乏力、月經異常等。
消化障礙如食而不消、不思飲食、胃脹胃痛、便秘等，這時除了適當的坐禪外，還要放鬆心情，適度增加經行、跑香、肢體放鬆運動來加強腸胃蠕動、促進消化，或者吃些消食的果蔬、藥劑等調治便秘、胃脹胃痛。
睡眼障礙如失眠、多夢、惡夢等，行者如果太過精進、勇猛，晚上會造成入睡困難。初學行者正常休息時，當放鬆心情、避免對業處的繼續專注，一般就可以消除入睡障礙。行者如果禪修中常常心隨欲馳而導致妄想紛飛，晚上則會多夢。行者如果禪修中常陷入昏昧、常憶念過去種種不善境或起惡見、惡欲而令其增長，睡眠中則多惡夢。行者禪修時當努力保持正念、平穩情緒、淡泊心志，睡夢自會減少。
在密集禪修中，行者通常被要求至少持守八戒。八戒中除了不淫戒，另外的不飲酒、不著香花鬘不香油塗身不歌舞娼伎不故往觀聽、不坐臥高廣大床、不非時食等四條戒，雖然各自有其獨立的內容，但也是從不同的方面來保護不淫戒，因為不淫是禪修相當重要的助行。但是行者如果在有一定時日的持續禪修中貪著男女，則會引起性欲增盛、煩躁易怒、情緒波動大、精神不集中、入睡困難等，其中男性發生頻繁的滑精、遺精，女性出現低熱、乏力、月經異常等。這時行者當修不淨觀以對治於男女的貪著，其中女性行者同時注意調整飲食、睡眠、心情，以保持良好的飲食、充足的睡眠、愉悅的心情。
在禪修時，行者如果粘著於自己過去種種不良境遇或世間的無常、有情的苦難，其心情則會沉湎於憂愁或悲傷中，障礙正常禪修，乃至持續影響日後的正常生活、工作與學習。這樣時間久了會導致抑鬱、焦慮、哭泣，甚至產生消極、絕望、自殺的念頭。行者應及時修習喜心與舍心，並觀修出離樂、解脫樂、菩提樂，以消解對自己、對世間有情的憂愁與悲傷。
行者如果粘著於善法的出現與持續，其心情則可能沉湎於狂喜或我慢。如法禪修的行者在發定或觀智成熟之前，會經驗到身心輕安、心智敏銳、身輕自舉、見光聽微等前所未有的境界，由此心生喜樂。喜樂本身不是禪病，若行者樂於此喜、執於此喜、不能自已，是為狂喜，是為禪病；甚至有行者認為此時自己已經超凡入聖、解脫自在了，是為增上慢，同為禪病。行者當于此等善法觀察苦、無常、無我而斷除法執，則能繼續向上進修成就止觀。
行者禪修中有時出現妄想是正常的，但如果時常陷入妄想而不能自拔，或者喜於妄想、樂於妄想、執於妄想，以住於妄想為定、為成就，此即為禪病。有些妄想是沉湎於過去，多數則是幻想于未來或臆想於當下，這樣時間久了禪修者會脫離當下現實而生活於回憶、幻想或臆想之中，嚴重者會導致精神分裂。輕度者可由提起正念覺知當下來恢復正常的心智，重症者當立即停止禪修回家靜養或接受治療。
行者禪修時有時出現昏沉是正常的，但如果時常陷入昏沉而不能自調，或者喜於昏沉、樂於昏沉、執於昏沉，以為住於昏沉是定、是解脫，此即為禪病。時間長了則行者心智愚鈍、魂不守舍、面色灰暗、體質下降。昏沉如因睡眠不足，行者當補足睡眠再上座禪修。若睡眠已經充足，行者當提起精進、發起勇猛，通過多種善巧、方便來恢復正念、克服昏沉。如昏沉較輕時，在座上用手搓臉、按摩頭部、扣齒、拉扯耳朵、輕緩地搖動身體、暫時深呼吸，即可減輕或消除昏沉；如昏沉較重時，可下座用冷水洗臉、做些放鬆運動，若還是反復昏沉則下座經行、跑香，直到消除昏沉。
有些行者學佛修行是為了貪求眼前世間的名聞利養、男歡女愛或者過人神通，因為功利心強而發邪念邪思，行者不僅不能成就絲毫的出世間的善法，最後還會導致破見、破戒而落入魔掌、墮向惡道。行者如果發心不良而喜於欲、樂於欲、執於欲、住於欲，為欲貪所縛，則為欲魔所控。此時行者當多修苦觀、無常觀、無我觀、內外不淨觀，以遠離對五欲妙境的種種貪著。
行者如果只見諸法因緣滅不見諸法因緣生，則會喜於空、樂於空、執於空、住於空而取頑空邪見。頑空邪見者如斷見者、虛無主義者、撥無因果者，他們既破壞世間法，又破壞出世間法，是惡見者、破見者、墮落者。行者除了觀察諸法因緣滅來破除有見，同時也要觀察諸法因緣生來破除頑空見，不偏有也不偏空，以此確立中道正見。
行者如果因用心不當而出現幻覺、知覺扭曲，則可能導致情緒錯亂、精神發狂。幻覺如幻視、幻聽，本來沒有發生的事情行者以為發生了。知覺扭曲如顛倒苦樂、憂喜、善惡、美醜、勝劣等，行者對身邊人與事的覺受與反映跟常人反差很大。出現幻覺與知覺扭曲都可能導致行者情緒錯亂甚至精神發狂。程度輕者通過經行、躺臥等適度的放鬆、休息就可以恢復正念、消除症狀，程度重者則應立即停止禪修，回家靜養或者接受治療。
行者如果愚鈍或意志薄弱，禪修時容易陷入昏昧而魂不守舍，則可能為鬼魅乘虛而入。為鬼魅侵入的人好象換了一個人，而且與常人大不相同，說古怪話做離奇事，有的會有超乎常人的能力，有的會有自虐、自殘行為，有的則表現為言行癲狂。被鬼魅侵入的行者通常無力自救，一般要依靠有道之人依法力遣走鬼怪。
以上種種禪病不一而足，但心理方面的禪病基本上都是方法、用心不當所造成的五陰魔境，唯有恢復正念、通過觀察諸法苦、無常、無我三相，才能從五陰魔境中徹底解脫出來。